Protein–RNA interactions for Protein: Q12004

TFB4, General transcription and DNA repair factor IIH subunit TFB4, yeastyeast

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TFB4Q12004 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt9.3□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 MTR2YKL186C 555 nt9.3□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 VHS2YIL135C 1311 nt9.3□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 PAF1YBR279W 1338 nt9.3□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 SPT20YOL148C 1815 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 MPC54YOR177C 1395 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 CDC10YCR002C 969 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 MAK32YCR019W 1092 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 PEX7YDR142C 1128 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 YEL008WYEL008W 381 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 ADH4YGL256W 1149 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 MRP13YGR084C 1020 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 PFA4YOL003C 1137 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 MTG2YHR168W 1557 nt9.29□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 VAC17YCL063W 1272 nt9.28□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 UFD1YGR048W 1086 nt9.28□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 SEN2YLR105C 1134 nt9.28□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 FCY21YER060W 1587 nt9.28□□□□□ -0.92
TFB4Q12004 ADH7YCR105W 1086 nt9.27□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 MCM21YDR318W 1107 nt9.27□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 YFL019CYFL019C 354 nt9.27□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 THI80YOR143C 960 nt9.27□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 RKM4YDR257C 1485 nt9.27□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 AKR2YOR034C 2250 nt9.26□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 UTR1YJR049C 1593 nt9.26□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 snR56snR56 88 nt9.26□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 APT2YDR441C 546 nt9.26□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 CSM3YMR048W 954 nt9.26□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 YFR045WYFR045W 930 nt9.25□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 RRT6YGL146C 936 nt9.25□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 LST7YGR057C 729 nt9.25□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 GET3YDL100C 1065 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 PCL9YDL179W 915 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 TRP1YDR007W 675 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 YAP6YDR259C 1152 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 DIN7YDR263C 1293 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 XPT1YJR133W 630 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 COG5YNL051W 1212 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 CLP1YOR250C 1338 nt9.24□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 PAU15YIR041W 375 nt9.23□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 CCE1YKL011C 1062 nt9.23□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 AVO2YMR068W 1281 nt9.23□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 CTL1YMR180C 963 nt9.23□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 YNL171CYNL171C 369 nt9.23□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 PHA2YNL316C 1005 nt9.23□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 YCR016WYCR016W 873 nt9.22□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 CWC15YDR163W 528 nt9.22□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 GEP7YGL057C 864 nt9.22□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 SMM1YNR015W 1155 nt9.22□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 MLS1YNL117W 1665 nt9.22□□□□□ -0.93
TFB4Q12004 YCR006CYCR006C 474 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 TVP23YDR084C 600 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ARI1YGL157W 1044 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 SAM35YHR083W 990 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YIR021W-AYIR021W-A 213 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 HCR1YLR192C 798 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 RNH1YMR234W 1047 nt9.21□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 PIB1YDR313C 861 nt9.2□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 CPD1YGR247W 720 nt9.2□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 REV7YIL139C 738 nt9.2□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 SPC42YKL042W 1092 nt9.2□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YOR020W-AYOR020W-A 273 nt9.2□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ALG5YPL227C 1005 nt9.2□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 SHR3YDL212W 633 nt9.19□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YHL045WYHL045W 348 nt9.19□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 MRPL23YOR150W 492 nt9.19□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 CSG2YBR036C 1233 nt9.19□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 LSB3YFR024C-A 1380 nt9.19□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 NBP2YDR162C 711 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 OMS1YDR316W 1416 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ORM1YGR038W 669 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 HXT12YIL170W 1374 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 PPA2YMR267W 933 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ALD4YOR374W 1560 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YPR027CYPR027C 834 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 PBP2YBR233W 1242 nt9.18□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 FRA1YLL029W 2250 nt9.17□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YLR271WYLR271W 825 nt9.17□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 RTC4YNL254C 1206 nt9.17□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 TLG2YOL018C 1194 nt9.17□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YBR134WYBR134W 402 nt9.17□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 CIT2YCR005C 1383 nt9.16□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 SED1YDR077W 1017 nt9.16□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YFR057WYFR057W 456 nt9.16□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 MTQ1YNL063W 945 nt9.16□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 RPN8YOR261C 1017 nt9.16□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 VBA3YCL069W 1377 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ARG7YMR062C 1326 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 YDR222WYDR222W 1248 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ERP5YHR110W 639 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 DCG1YIR030C 735 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 ESS1YJR017C 513 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 FIP1YJR093C 984 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 MRP7YNL005C 1116 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 RUF5-1RUF5-1 710 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 RUF5-2RUF5-2 710 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 DCI1YOR180C 816 nt9.15□□□□□ -0.94
TFB4Q12004 PCI8YIL071C 1335 nt9.14□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 SPO12YHR152W 522 nt9.14□□□□□ -0.95
TFB4Q12004 MUP1YGR055W 1725 nt9.14□□□□□ -0.95
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