Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
LRP1Q07954 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
LRP1Q07954 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LRP1Q07954 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms