Protein–RNA interactions for Protein: Q06455

RUNX1T1, Protein CBFA2T1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX1T1Q06455 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RUNX1T1Q06455 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RUNX1T1Q06455 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RUNX1T1Q06455 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
RUNX1T1Q06455 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.8 ms