Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 AOS1YPR180W 1044 nt7.1□□□□□ -1.27
NEJ1Q06148 TOD6YBL054W 1578 nt7.1□□□□□ -1.27
NEJ1Q06148 CCR4YAL021C 2514 nt7.09□□□□□ -1.27
NEJ1Q06148 PAU15YIR041W 375 nt7.09□□□□□ -1.27
NEJ1Q06148 SRP102YKL154W 735 nt7.09□□□□□ -1.27
NEJ1Q06148 YLR280CYLR280C 351 nt7.09□□□□□ -1.27
NEJ1Q06148 MAS2YHR024C 1449 nt7.09□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 SEC24YIL109C 2781 nt7.08□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 PET10YKR046C 852 nt7.08□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 SNF7YLR025W 723 nt7.08□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 RMD8YFR048W 1989 nt7.08□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YNL040WYNL040W 1371 nt7.08□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YJL043WYJL043W 774 nt7.07□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 MNN9YPL050C 1188 nt7.07□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 TPI1YDR050C 747 nt7.06□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 FLX1YIL134W 936 nt7.06□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 CYC3YAL039C 810 nt7.06□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 PRE10YOR362C 867 nt7.06□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 GUT1YHL032C 2130 nt7.06□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 TCB1YOR086C 3561 nt7.05□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 CAN1YEL063C 1773 nt7.05□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 APT1YML022W 564 nt7.05□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.05□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 RTC2YBR147W 891 nt7.05□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 STF1YDL130W-A 261 nt7.04□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YPT31YER031C 672 nt7.04□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 CAK1YFL029C 1107 nt7.04□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YHR033WYHR033W 1272 nt7.04□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 HRA1HRA1 564 nt7.04□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 VPS65YLR322W 315 nt7.03□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YMR166CYMR166C 1107 nt7.03□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 YIL108WYIL108W 2091 nt7.03□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 HNM1YGL077C 1692 nt7.03□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 ERO1YML130C 1692 nt7.03□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 MSS51YLR203C 1311 nt7.02□□□□□ -1.28
NEJ1Q06148 RAD51YER095W 1203 nt7.02□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 PAU5YFL020C 369 nt7.02□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 STP3YLR375W 1032 nt7.02□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 ARG7YMR062C 1326 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 TIM50YPL063W 1431 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 FLC2YAL053W 2352 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 DST1YGL043W 930 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 CAR2YLR438W 1275 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 RFS1YBR052C 633 nt7.01□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 NAP1YKR048C 1254 nt7□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 YDR306CYDR306C 1437 nt7□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 AFG2YLR397C 2343 nt6.99□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 CKI1YLR133W 1749 nt6.98□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 YDR215CYDR215C 414 nt6.97□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 PRY2YKR013W 990 nt6.97□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 ERV25YML012W 636 nt6.97□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 ENB1YOL158C 1821 nt6.97□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 HXT13YEL069C 1695 nt6.96□□□□□ -1.29
NEJ1Q06148 YDR327WYDR327W 327 nt6.96□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 RRT14YIL127C 621 nt6.96□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 PMU1YKL128C 888 nt6.96□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 PGC1YPL206C 966 nt6.96□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 IPL1YPL209C 1104 nt6.96□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YAH1YPL252C 519 nt6.96□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YJL045WYJL045W 1905 nt6.95□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YBL111CYBL111C 2004 nt6.95□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 JHD1YER051W 1479 nt6.94□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 BXI1YNL305C 894 nt6.94□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YPC1YBR183W 951 nt6.94□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 FCP1YMR277W 2199 nt6.93□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 LSP1YPL004C 1026 nt6.93□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 FCY2YER056C 1602 nt6.92□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 CPR2YHR057C 618 nt6.92□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 LOT6YLR011W 576 nt6.92□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YBR232CYBR232C 360 nt6.92□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 PPS1YBR276C 2424 nt6.91□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YCR041WYCR041W 333 nt6.91□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 SNF4YGL115W 969 nt6.91□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 AIM2YAL049C 741 nt6.91□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YGL260WYGL260W 231 nt6.9□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YKL147CYKL147C 618 nt6.9□□□□□ -1.3
NEJ1Q06148 YOR012WYOR012W 414 nt6.89□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 LIP5YOR196C 1245 nt6.89□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 SRF1YDL133W 1314 nt6.88□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 ERG24YNL280C 1317 nt6.88□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 PAC10YGR078C 600 nt6.88□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 YGR210CYGR210C 1236 nt6.88□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 DAL80YKR034W 810 nt6.88□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 NUP57YGR119C 1626 nt6.87□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 PPZ2YDR436W 2133 nt6.87□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 YLR112WYLR112W 420 nt6.87□□□□□ -1.31
NEJ1Q06148 YPL108WYPL108W 507 nt6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10 ms