Protein–RNA interactions for Protein: Q02629

NUP100, Nucleoporin NUP100/NSP100, yeastyeast

Predictions only

Length 959 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NUP100Q02629 DST1YGL043W 930 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 KAE1YKR038C 1161 nt7.63□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 SPR1YOR190W 1338 nt7.62□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 MDL2YPL270W 2322 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 DIA4YHR011W 1341 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 PNS1YOR161C 1620 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 FUS3YBL016W 1062 nt7.61□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 CPR2YHR057C 618 nt7.6□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 CPT1YNL130C 1182 nt7.6□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 RRT6YGL146C 936 nt7.59□□□□□ -1.19
NUP100Q02629 PET494YNR045W 1470 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 AOS1YPR180W 1044 nt7.58□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 HAM1YJR069C 594 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 MET8YBR213W 825 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 BSP1YPR171W 1731 nt7.57□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 TPO1YLL028W 1761 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 ESBP6YNL125C 2022 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 STE3YKL178C 1413 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 CDA1YLR307W 906 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 Q0010Q0010 387 nt7.56□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 YDR476CYDR476C 675 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 EDC2YER035W 438 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 NCA3YJL116C 1014 nt7.55□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 RPL2AYFR031C-A 765 nt7.54□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 RRP43YCR035C 1185 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 TES1YJR019C 1050 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 YNL295WYNL295W 1575 nt7.53□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 DUS3YLR401C 2007 nt7.52□□□□□ -1.2
NUP100Q02629 YJR154WYJR154W 1041 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 YML034C-AYML034C-A 399 nt7.52□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 ADE16YLR028C 1776 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 PMT1YDL095W 2454 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 AVL9YLR114C 2295 nt7.51□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 MET13YGL125W 1803 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 YHR033WYHR033W 1272 nt7.5□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 INP54YOL065C 1155 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 ERV2YPR037C 591 nt7.49□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 CKB1YGL019W 837 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 YOR268CYOR268C 399 nt7.48□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 GTB1YDR221W 2109 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 UFD1YGR048W 1086 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 ERV25YML012W 636 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 CRN1YLR429W 1956 nt7.47□□□□□ -1.21
NUP100Q02629 PSA1YDL055C 1086 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 YDR510C-AYDR510C-A 117 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 YLR358CYLR358C 564 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 MDH2YOL126C 1134 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 YPC1YBR183W 951 nt7.46□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 SPS1YDR523C 1473 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 STS1YIR011C 960 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 YJR142WYJR142W 1029 nt7.45□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 PEX28YHR150W 1740 nt7.44□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 FIT1YDR534C 1587 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 PMT7YDR307W 1989 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 DAL80YKR034W 810 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 VPS65YLR322W 315 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 PDC5YLR134W 1692 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 PPZ2YDR436W 2133 nt7.43□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 YDR215CYDR215C 414 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 PET10YKR046C 852 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 RCF2YNR018W 675 nt7.42□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 DOC1YGL240W 753 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 NMA2YGR010W 1188 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 BAP3YDR046C 1815 nt7.41□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 GET2YER083C 858 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 YPT10YBR264C 600 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 PFS2YNL317W 1398 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 LEO1YOR123C 1395 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 OSM1YJR051W 1506 nt7.4□□□□□ -1.22
NUP100Q02629 RSC9YML127W 1746 nt7.4□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 ILV2YMR108W 2064 nt7.4□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 DTR1YBR180W 1719 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 HSV2YGR223C 1347 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 SNA3YJL151C 402 nt7.39□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 HRB1YNL004W 1365 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 CAR2YLR438W 1275 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 MSI1YBR195C 1269 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 SGF73YGL066W 1974 nt7.38□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 OPI1YHL020C 1215 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 DSC3YOR223W 879 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 BDS1YOL164W 1941 nt7.37□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 RUP1YOR138C 2016 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 SKP1YDR328C 585 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 YGL081WYGL081W 963 nt7.36□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 CDC3YLR314C 1563 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 PRE5YMR314W 705 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 ADH6YMR318C 1083 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 LPD1YFL018C 1500 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 GAL2YLR081W 1725 nt7.35□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 PIH1YHR034C 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
NUP100Q02629 MFG1YDL233W 1377 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 PRY2YKR013W 990 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 YML079WYML079W 606 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 ATP23YNR020C 813 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 MAS2YHR024C 1449 nt7.33□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 SLM3YDL033C 1254 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 YGR139WYGR139W 339 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 SNF7YLR025W 723 nt7.32□□□□□ -1.24
NUP100Q02629 YBL113CYBL113C 2379 nt7.31□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 28.4 ms