Protein–RNA interactions for Protein: Q02161

RHD, Blood group Rh(D) polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHDQ02161 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RHDQ02161 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHDQ02161 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHDQ02161 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RHDQ02161 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHDQ02161 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHDQ02161 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RHDQ02161 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RHDQ02161 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHDQ02161 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHDQ02161 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHDQ02161 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RHDQ02161 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHDQ02161 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHDQ02161 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHDQ02161 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RHDQ02161 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHDQ02161 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RHDQ02161 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHDQ02161 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHDQ02161 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHDQ02161 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHDQ02161 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RHDQ02161 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHDQ02161 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHDQ02161 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHDQ02161 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHDQ02161 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RHDQ02161 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHDQ02161 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHDQ02161 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHDQ02161 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHDQ02161 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHDQ02161 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RHDQ02161 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
RHDQ02161 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHDQ02161 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHDQ02161 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHDQ02161 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHDQ02161 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
RHDQ02161 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RHDQ02161 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
RHDQ02161 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RHDQ02161 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHDQ02161 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHDQ02161 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHDQ02161 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHDQ02161 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RHDQ02161 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHDQ02161 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHDQ02161 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHDQ02161 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHDQ02161 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
RHDQ02161 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHDQ02161 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
RHDQ02161 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHDQ02161 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
RHDQ02161 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
RHDQ02161 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHDQ02161 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHDQ02161 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHDQ02161 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHDQ02161 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHDQ02161 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RHDQ02161 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHDQ02161 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHDQ02161 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHDQ02161 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RHDQ02161 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RHDQ02161 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHDQ02161 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHDQ02161 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHDQ02161 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RHDQ02161 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.5 ms