Protein–RNA interactions for Protein: Q02156

PRKCE, Protein kinase C epsilon type, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCEQ02156 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PRKCEQ02156 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PRKCEQ02156 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PRKCEQ02156 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
PRKCEQ02156 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 247.7 ms