Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CACNA1DQ01668 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CACNA1DQ01668 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CACNA1DQ01668 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CACNA1DQ01668 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CACNA1DQ01668 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms