Protein–RNA interactions for Protein: P89113

DDR2, Protein DDR2, yeast

Predictions only

Length 61 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DDR2	P89113	MTC6	YHR151C	1581 nt		5.04	□□□□□ -1.6
DDR2	P89113	YHR033W	YHR033W	1272 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DDR2	P89113	YLR030W	YLR030W	792 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DDR2	P89113	MNN9	YPL050C	1188 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DDR2	P89113	YPR084W	YPR084W	1371 nt		5.03	□□□□□ -1.6
DDR2	P89113	YMR206W	YMR206W	942 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	MAL31	YBR298C	1845 nt		5.02	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	JHD1	YER051W	1479 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	YER156C	YER156C	1017 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	CPR2	YHR057C	618 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	AOS1	YPR180W	1044 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	RTC2	YBR147W	891 nt		5.01	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	RCF2	YNR018W	675 nt		5	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	RPL12B	YDR418W	498 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	GTS1	YGL181W	1191 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	HAM1	YJR069C	594 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	LEO1	YOR123C	1395 nt		4.99	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	SEN2	YLR105C	1134 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	CAR2	YLR438W	1275 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	PAU19	YMR325W	375 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	BXI1	YNL305C	894 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	TCB1	YOR086C	3561 nt		4.98	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	ATP2	YJR121W	1536 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	YNL040W	YNL040W	1371 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	TGA1	tA(UGC)A	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	tA(UGC)E	tA(UGC)E	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	tA(UGC)G	tA(UGC)G	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	tA(UGC)L	tA(UGC)L	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	tA(UGC)O	tA(UGC)O	73 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	YJL064W	YJL064W	396 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	NSG2	YNL156C	900 nt		4.97	□□□□□ -1.61
DDR2	P89113	TPI1	YDR050C	747 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YDR215C	YDR215C	414 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YER137C	YER137C	447 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	DST1	YGL043W	930 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	APT1	YML022W	564 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YOR041C	YOR041C	432 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	DCR2	YLR361C	1737 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	CDC23	YHR166C	1881 nt		4.96	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	SNA3	YJL151C	402 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	ATO2	YNR002C	849 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	RPS6A	YPL090C	711 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	RPS6B	YBR181C	711 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YBL113C	YBL113C	2379 nt		4.95	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	PMA2	YPL036W	2844 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YCP4	YCR004C	744 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	SWM1	YDR260C	513 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YJL043W	YJL043W	774 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	MFT1	YML062C	1179 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YMR007W	YMR007W	381 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	FCY1	YPR062W	477 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	CKI1	YLR133W	1749 nt		4.94	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	NDE1	YMR145C	1683 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YDR327W	YDR327W	327 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	MAS2	YHR024C	1449 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	RCR1	YBR005W	642 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	CAN1	YEL063C	1773 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	BNA3	YJL060W	1335 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	MSS51	YLR203C	1311 nt		4.93	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	PRB1	YEL060C	1908 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YJL160C	YJL160C	864 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	VPS65	YLR322W	315 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YAH1	YPL252C	519 nt		4.92	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	YKR018C	YKR018C	2178 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	PET18	YCR020C	648 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	HNM1	YGL077C	1692 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	ERG24	YNL280C	1317 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	TOD6	YBL054W	1578 nt		4.91	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	STE3	YKL178C	1413 nt		4.9	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	SEC24	YIL109C	2781 nt		4.9	□□□□□ -1.62
DDR2	P89113	OPI1	YHL020C	1215 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	HRA1	HRA1	564 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	DAL80	YKR034W	810 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YPC1	YBR183W	951 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YIL108W	YIL108W	2091 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	FLC2	YAL053W	2352 nt		4.9	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	HXT13	YEL069C	1695 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	RTG2	YGL252C	1767 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	GET2	YER083C	858 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YNR001W-A	YNR001W-A	219 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	INP54	YOL065C	1155 nt		4.89	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	MHP1	YJL042W	4197 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YGL260W	YGL260W	231 nt		4.88	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YGR068W-A	YGR068W-A	96 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YKL147C	YKL147C	618 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	ERV25	YML012W	636 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YNL295W	YNL295W	1575 nt		4.87	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	RRP43	YCR035C	1185 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	TDH1	YJL052W	999 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	PRY2	YKR013W	990 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	RFC1	YOR217W	2586 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	BAP3	YDR046C	1815 nt		4.86	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	AFG3	YER017C	2286 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	RFS1	YBR052C	633 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	ENB1	YOL158C	1821 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	RMD8	YFR048W	1989 nt		4.85	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	BDS1	YOL164W	1941 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YIL168W	YIL168W	384 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	YPT10	YBR264C	600 nt		4.84	□□□□□ -1.63
DDR2	P89113	PSP2	YML017W	1782 nt		4.83	□□□□□ -1.64

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