Protein–RNA interactions for Protein: P84077

ARF1, ADP-ribosylation factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF1P84077 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF1P84077 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF1P84077 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ARF1P84077 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ARF1P84077 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF1P84077 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF1P84077 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF1P84077 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ARF1P84077 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF1P84077 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF1P84077 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ARF1P84077 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF1P84077 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF1P84077 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF1P84077 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF1P84077 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ARF1P84077 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF1P84077 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF1P84077 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF1P84077 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF1P84077 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ARF1P84077 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF1P84077 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ARF1P84077 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF1P84077 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
ARF1P84077 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF1P84077 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF1P84077 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF1P84077 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF1P84077 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF1P84077 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
ARF1P84077 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF1P84077 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF1P84077 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF1P84077 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF1P84077 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF1P84077 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ARF1P84077 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF1P84077 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF1P84077 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
ARF1P84077 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ARF1P84077 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF1P84077 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF1P84077 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF1P84077 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF1P84077 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF1P84077 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ARF1P84077 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ARF1P84077 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF1P84077 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ARF1P84077 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF1P84077 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ARF1P84077 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF1P84077 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF1P84077 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF1P84077 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ARF1P84077 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF1P84077 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF1P84077 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF1P84077 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF1P84077 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF1P84077 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ARF1P84077 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF1P84077 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF1P84077 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF1P84077 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF1P84077 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF1P84077 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ARF1P84077 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF1P84077 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF1P84077 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF1P84077 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF1P84077 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF1P84077 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ARF1P84077 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF1P84077 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF1P84077 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ARF1P84077 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140.5 ms