Protein–RNA interactions for Protein: P83105

HTRA4, Serine protease HTRA4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA4P83105 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
HTRA4P83105 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HTRA4P83105 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA4P83105 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA4P83105 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA4P83105 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA4P83105 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HTRA4P83105 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HTRA4P83105 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HTRA4P83105 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTRA4P83105 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HTRA4P83105 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HTRA4P83105 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HTRA4P83105 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HTRA4P83105 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HTRA4P83105 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
HTRA4P83105 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HTRA4P83105 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
HTRA4P83105 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA4P83105 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA4P83105 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA4P83105 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA4P83105 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA4P83105 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HTRA4P83105 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
HTRA4P83105 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
HTRA4P83105 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■■□□ 2
HTRA4P83105 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
HTRA4P83105 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
HTRA4P83105 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
HTRA4P83105 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms