Protein–RNA interactions for Protein: P78415

IRX3, Iroquois-class homeodomain protein IRX-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX3P78415 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX3P78415 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
IRX3P78415 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX3P78415 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX3P78415 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
IRX3P78415 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
IRX3P78415 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
IRX3P78415 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX3P78415 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX3P78415 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
IRX3P78415 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX3P78415 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX3P78415 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX3P78415 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
IRX3P78415 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
IRX3P78415 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX3P78415 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX3P78415 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX3P78415 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX3P78415 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
IRX3P78415 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX3P78415 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
IRX3P78415 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
IRX3P78415 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
IRX3P78415 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX3P78415 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX3P78415 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX3P78415 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX3P78415 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
IRX3P78415 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX3P78415 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX3P78415 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX3P78415 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX3P78415 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX3P78415 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
IRX3P78415 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
IRX3P78415 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX3P78415 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
IRX3P78415 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX3P78415 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX3P78415 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX3P78415 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX3P78415 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
IRX3P78415 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX3P78415 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX3P78415 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX3P78415 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX3P78415 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX3P78415 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
IRX3P78415 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX3P78415 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX3P78415 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX3P78415 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
IRX3P78415 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX3P78415 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX3P78415 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX3P78415 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
IRX3P78415 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
IRX3P78415 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX3P78415 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX3P78415 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
IRX3P78415 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX3P78415 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX3P78415 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
IRX3P78415 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX3P78415 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
IRX3P78415 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX3P78415 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
IRX3P78415 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX3P78415 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX3P78415 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX3P78415 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
IRX3P78415 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX3P78415 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX3P78415 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX3P78415 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX3P78415 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX3P78415 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
IRX3P78415 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX3P78415 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
IRX3P78415 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX3P78415 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX3P78415 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX3P78415 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
IRX3P78415 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms