Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
SNRPFP62306 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SNRPFP62306 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SNRPFP62306 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SNRPFP62306 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms