Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF3P61204 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ARF3P61204 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF3P61204 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF3P61204 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ARF3P61204 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ARF3P61204 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ARF3P61204 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF3P61204 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF3P61204 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF3P61204 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ARF3P61204 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF3P61204 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF3P61204 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF3P61204 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ARF3P61204 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF3P61204 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF3P61204 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ARF3P61204 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ARF3P61204 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF3P61204 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF3P61204 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ARF3P61204 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ARF3P61204 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARF3P61204 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARF3P61204 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARF3P61204 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ARF3P61204 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARF3P61204 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARF3P61204 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARF3P61204 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARF3P61204 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARF3P61204 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARF3P61204 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARF3P61204 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARF3P61204 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARF3P61204 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARF3P61204 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARF3P61204 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARF3P61204 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARF3P61204 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF3P61204 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF3P61204 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF3P61204 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF3P61204 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARF3P61204 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARF3P61204 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARF3P61204 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF3P61204 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARF3P61204 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARF3P61204 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF3P61204 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF3P61204 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF3P61204 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARF3P61204 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARF3P61204 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF3P61204 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF3P61204 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF3P61204 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF3P61204 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARF3P61204 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF3P61204 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF3P61204 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF3P61204 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARF3P61204 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARF3P61204 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms