Protein–RNA interactions for Protein: P56747

CLDN6, Claudin-6, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN6P56747 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CLDN6P56747 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLDN6P56747 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
CLDN6P56747 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
CLDN6P56747 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms