Protein–RNA interactions for Protein: P56134

ATP5J2, ATP synthase subunit f, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5J2P56134 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATP5J2P56134 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP5J2P56134 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP5J2P56134 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP5J2P56134 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms