Protein–RNA interactions for Protein: P55283

CDH4, Cadherin-4, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH4P55283 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH4P55283 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH4P55283 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH4P55283 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CDH4P55283 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH4P55283 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH4P55283 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH4P55283 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH4P55283 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CDH4P55283 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDH4P55283 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDH4P55283 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH4P55283 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH4P55283 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDH4P55283 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDH4P55283 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH4P55283 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH4P55283 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH4P55283 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDH4P55283 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH4P55283 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH4P55283 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH4P55283 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH4P55283 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDH4P55283 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH4P55283 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH4P55283 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH4P55283 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH4P55283 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDH4P55283 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH4P55283 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH4P55283 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDH4P55283 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDH4P55283 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH4P55283 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH4P55283 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDH4P55283 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH4P55283 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH4P55283 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH4P55283 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDH4P55283 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH4P55283 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH4P55283 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDH4P55283 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH4P55283 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDH4P55283 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH4P55283 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CDH4P55283 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH4P55283 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH4P55283 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CDH4P55283 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH4P55283 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDH4P55283 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDH4P55283 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH4P55283 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDH4P55283 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH4P55283 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH4P55283 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDH4P55283 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH4P55283 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH4P55283 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH4P55283 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDH4P55283 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDH4P55283 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CDH4P55283 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH4P55283 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH4P55283 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH4P55283 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH4P55283 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH4P55283 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CDH4P55283 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CDH4P55283 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms