Protein–RNA interactions for Protein: P54845

NRL, Neural retina-specific leucine zipper protein, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRLP54845 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRLP54845 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
NRLP54845 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRLP54845 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRLP54845 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRLP54845 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRLP54845 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
NRLP54845 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRLP54845 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRLP54845 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRLP54845 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
NRLP54845 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRLP54845 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRLP54845 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRLP54845 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRLP54845 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
NRLP54845 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
NRLP54845 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRLP54845 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
NRLP54845 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
NRLP54845 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRLP54845 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRLP54845 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
NRLP54845 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRLP54845 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRLP54845 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRLP54845 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
NRLP54845 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRLP54845 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
NRLP54845 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
NRLP54845 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
NRLP54845 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRLP54845 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
NRLP54845 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRLP54845 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRLP54845 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRLP54845 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
NRLP54845 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NRLP54845 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
NRLP54845 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
NRLP54845 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRLP54845 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRLP54845 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
NRLP54845 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRLP54845 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRLP54845 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRLP54845 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRLP54845 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
NRLP54845 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRLP54845 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRLP54845 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
NRLP54845 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRLP54845 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRLP54845 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRLP54845 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
NRLP54845 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRLP54845 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
NRLP54845 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRLP54845 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
NRLP54845 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
NRLP54845 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
NRLP54845 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRLP54845 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRLP54845 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRLP54845 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
NRLP54845 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
NRLP54845 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
NRLP54845 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRLP54845 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
NRLP54845 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRLP54845 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRLP54845 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRLP54845 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRLP54845 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRLP54845 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
NRLP54845 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRLP54845 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRLP54845 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRLP54845 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRLP54845 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
NRLP54845 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRLP54845 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRLP54845 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRLP54845 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
NRLP54845 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRLP54845 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRLP54845 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRLP54845 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRLP54845 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRLP54845 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
NRLP54845 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRLP54845 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRLP54845 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
NRLP54845 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms