Protein–RNA interactions for Protein: P54259

ATN1, Atrophin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATN1P54259 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATN1P54259 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATN1P54259 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ATN1P54259 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ATN1P54259 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATN1P54259 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ATN1P54259 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ATN1P54259 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ATN1P54259 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATN1P54259 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ATN1P54259 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATN1P54259 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATN1P54259 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATN1P54259 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ATN1P54259 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATN1P54259 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATN1P54259 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATN1P54259 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ATN1P54259 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATN1P54259 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ATN1P54259 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ATN1P54259 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATN1P54259 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATN1P54259 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATN1P54259 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ATN1P54259 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ATN1P54259 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATN1P54259 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATN1P54259 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ATN1P54259 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATN1P54259 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ATN1P54259 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATN1P54259 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATN1P54259 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ATN1P54259 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATN1P54259 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATN1P54259 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATN1P54259 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ATN1P54259 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
ATN1P54259 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ATN1P54259 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATN1P54259 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATN1P54259 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ATN1P54259 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ATN1P54259 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
ATN1P54259 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATN1P54259 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATN1P54259 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATN1P54259 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATN1P54259 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATN1P54259 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATN1P54259 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATN1P54259 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATN1P54259 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
ATN1P54259 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATN1P54259 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATN1P54259 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATN1P54259 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATN1P54259 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ATN1P54259 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATN1P54259 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATN1P54259 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATN1P54259 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATN1P54259 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATN1P54259 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATN1P54259 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATN1P54259 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATN1P54259 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATN1P54259 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATN1P54259 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATN1P54259 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATN1P54259 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATN1P54259 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATN1P54259 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATN1P54259 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATN1P54259 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms