Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CLNS1AP54105 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CLNS1AP54105 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CLNS1AP54105 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
CLNS1AP54105 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CLNS1AP54105 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms