Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
SMTNP53814 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMTNP53814 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
SMTNP53814 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMTNP53814 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMTNP53814 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
SMTNP53814 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNP53814 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNP53814 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNP53814 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNP53814 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNP53814 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
SMTNP53814 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMTNP53814 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
SMTNP53814 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMTNP53814 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
SMTNP53814 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMTNP53814 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMTNP53814 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SMTNP53814 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNP53814 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNP53814 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNP53814 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNP53814 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SMTNP53814 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SMTNP53814 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNP53814 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNP53814 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNP53814 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNP53814 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNP53814 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SMTNP53814 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SMTNP53814 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SMTNP53814 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNP53814 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SMTNP53814 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNP53814 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNP53814 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNP53814 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SMTNP53814 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
SMTNP53814 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNP53814 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNP53814 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SMTNP53814 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNP53814 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNP53814 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNP53814 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
SMTNP53814 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNP53814 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNP53814 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNP53814 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SMTNP53814 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNP53814 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNP53814 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNP53814 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
SMTNP53814 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNP53814 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNP53814 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNP53814 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNP53814 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNP53814 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SMTNP53814 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNP53814 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNP53814 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNP53814 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNP53814 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNP53814 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SMTNP53814 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNP53814 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNP53814 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNP53814 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNP53814 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SMTNP53814 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNP53814 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNP53814 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SMTNP53814 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNP53814 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNP53814 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SMTNP53814 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SMTNP53814 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMTNP53814 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMTNP53814 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SMTNP53814 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNP53814 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNP53814 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SMTNP53814 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SMTNP53814 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms