Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
LIMK1P53667 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LIMK1P53667 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LIMK1P53667 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LIMK1P53667 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LIMK1P53667 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms