Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARFIP1P53367 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARFIP1P53367 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ARFIP1P53367 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ARFIP1P53367 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms