Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGDP52209 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGDP52209 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGDP52209 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGDP52209 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGDP52209 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PGDP52209 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGDP52209 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGDP52209 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGDP52209 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGDP52209 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGDP52209 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGDP52209 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGDP52209 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PGDP52209 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGDP52209 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGDP52209 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PGDP52209 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGDP52209 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGDP52209 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGDP52209 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PGDP52209 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PGDP52209 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGDP52209 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
PGDP52209 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGDP52209 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PGDP52209 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGDP52209 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
PGDP52209 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGDP52209 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGDP52209 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGDP52209 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PGDP52209 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGDP52209 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGDP52209 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PGDP52209 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGDP52209 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PGDP52209 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGDP52209 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGDP52209 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGDP52209 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PGDP52209 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
PGDP52209 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PGDP52209 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGDP52209 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGDP52209 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGDP52209 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PGDP52209 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PGDP52209 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PGDP52209 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGDP52209 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGDP52209 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PGDP52209 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGDP52209 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGDP52209 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGDP52209 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGDP52209 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PGDP52209 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGDP52209 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGDP52209 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGDP52209 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGDP52209 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PGDP52209 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGDP52209 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGDP52209 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PGDP52209 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PGDP52209 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGDP52209 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGDP52209 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGDP52209 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PGDP52209 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGDP52209 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGDP52209 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGDP52209 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGDP52209 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PGDP52209 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PGDP52209 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PGDP52209 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms