Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK7P50613 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CDK7P50613 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CDK7P50613 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK7P50613 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK7P50613 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK7P50613 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK7P50613 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CDK7P50613 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK7P50613 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK7P50613 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CDK7P50613 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK7P50613 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK7P50613 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK7P50613 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CDK7P50613 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK7P50613 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK7P50613 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK7P50613 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CDK7P50613 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK7P50613 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK7P50613 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK7P50613 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CDK7P50613 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK7P50613 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK7P50613 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CDK7P50613 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CDK7P50613 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK7P50613 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK7P50613 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK7P50613 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CDK7P50613 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CDK7P50613 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.12
CDK7P50613 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK7P50613 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK7P50613 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CDK7P50613 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK7P50613 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK7P50613 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CDK7P50613 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK7P50613 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK7P50613 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CDK7P50613 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK7P50613 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK7P50613 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK7P50613 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK7P50613 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CDK7P50613 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CDK7P50613 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK7P50613 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CDK7P50613 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK7P50613 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CDK7P50613 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK7P50613 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK7P50613 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK7P50613 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK7P50613 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CDK7P50613 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK7P50613 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK7P50613 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CDK7P50613 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK7P50613 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK7P50613 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CDK7P50613 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK7P50613 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK7P50613 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CDK7P50613 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CDK7P50613 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CDK7P50613 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK7P50613 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK7P50613 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK7P50613 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK7P50613 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CDK7P50613 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK7P50613 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK7P50613 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK7P50613 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK7P50613 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CDK7P50613 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK7P50613 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CDK7P50613 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.6 ms