Protein–RNA interactions for Protein: P49720

PSMB3, Proteasome subunit beta type-3, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB3P49720 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PSMB3P49720 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PSMB3P49720 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMB3P49720 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PSMB3P49720 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PSMB3P49720 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms