Protein–RNA interactions for Protein: P48960

CD97, CD97 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD97P48960 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CD97P48960 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CD97P48960 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD97P48960 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD97P48960 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CD97P48960 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD97P48960 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CD97P48960 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD97P48960 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD97P48960 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CD97P48960 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CD97P48960 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD97P48960 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD97P48960 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD97P48960 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD97P48960 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD97P48960 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CD97P48960 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD97P48960 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD97P48960 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD97P48960 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD97P48960 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD97P48960 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CD97P48960 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CD97P48960 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
CD97P48960 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CD97P48960 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
CD97P48960 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD97P48960 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD97P48960 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD97P48960 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CD97P48960 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
CD97P48960 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
CD97P48960 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CD97P48960 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CD97P48960 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD97P48960 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD97P48960 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD97P48960 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CD97P48960 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
CD97P48960 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD97P48960 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD97P48960 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD97P48960 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD97P48960 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CD97P48960 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD97P48960 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD97P48960 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD97P48960 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD97P48960 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD97P48960 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD97P48960 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD97P48960 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD97P48960 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD97P48960 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD97P48960 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD97P48960 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD97P48960 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD97P48960 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CD97P48960 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD97P48960 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD97P48960 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD97P48960 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD97P48960 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD97P48960 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD97P48960 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD97P48960 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD97P48960 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD97P48960 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms