Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
TM4SF4P48230 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
TM4SF4P48230 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TM4SF4P48230 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF4P48230 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF4P48230 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF4P48230 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms