Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UTRNP46939 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UTRNP46939 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
UTRNP46939 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
UTRNP46939 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
UTRNP46939 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
UTRNP46939 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
UTRNP46939 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
UTRNP46939 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
UTRNP46939 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
UTRNP46939 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
UTRNP46939 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
UTRNP46939 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
UTRNP46939 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
UTRNP46939 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UTRNP46939 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
UTRNP46939 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
UTRNP46939 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
UTRNP46939 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
UTRNP46939 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
UTRNP46939 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
UTRNP46939 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
UTRNP46939 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UTRNP46939 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
UTRNP46939 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
UTRNP46939 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
UTRNP46939 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
UTRNP46939 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
UTRNP46939 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
UTRNP46939 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
UTRNP46939 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC31.85■■■□□ 2.69
UTRNP46939 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
UTRNP46939 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UTRNP46939 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
UTRNP46939 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
UTRNP46939 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
UTRNP46939 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
UTRNP46939 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
UTRNP46939 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UTRNP46939 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.8■■■□□ 2.68
UTRNP46939 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
UTRNP46939 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
UTRNP46939 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
UTRNP46939 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
UTRNP46939 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
UTRNP46939 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.68
UTRNP46939 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
UTRNP46939 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms