Protein–RNA interactions for Protein: P46926

GNPDA1, Glucosamine-6-phosphate isomerase 1, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPDA1P46926 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GNPDA1P46926 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GNPDA1P46926 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GNPDA1P46926 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GNPDA1P46926 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms