Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
TNNT2P45379 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
TNNT2P45379 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC34.49■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
TNNT2P45379 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
TNNT2P45379 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.38■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.35■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TNNT2P45379 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms