Protein–RNA interactions for Protein: P43686

PSMC4, 26S proteasome regulatory subunit 6B, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMC4P43686 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PSMC4P43686 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
PSMC4P43686 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
PSMC4P43686 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PSMC4P43686 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PSMC4P43686 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms