Protein–RNA interactions for Protein: P34228

SEF1, Putative transcription factor SEF1, yeastyeast

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Length 1,148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SEF1P34228 YEL023CYEL023C 2049 nt7.25□□□□□ -1.25
SEF1P34228 NPP2YEL016C 1482 nt7.24□□□□□ -1.25
SEF1P34228 COS10YNR075W 1125 nt7.24□□□□□ -1.25
SEF1P34228 YMC2YBR104W 990 nt7.24□□□□□ -1.25
SEF1P34228 CTF3YLR381W 2202 nt7.24□□□□□ -1.25
SEF1P34228 YPR084WYPR084W 1371 nt7.23□□□□□ -1.25
SEF1P34228 PDC6YGR087C 1692 nt7.23□□□□□ -1.25
SEF1P34228 MRS4YKR052C 915 nt7.23□□□□□ -1.25
SEF1P34228 RNA170RNA170 169 nt7.23□□□□□ -1.25
SEF1P34228 AIM34YMR003W 597 nt7.22□□□□□ -1.25
SEF1P34228 OLA1YBR025C 1185 nt7.22□□□□□ -1.25
SEF1P34228 BUB2YMR055C 921 nt7.21□□□□□ -1.26
SEF1P34228 ATP2YJR121W 1536 nt7.21□□□□□ -1.26
SEF1P34228 ADE16YLR028C 1776 nt7.2□□□□□ -1.26
SEF1P34228 CCR4YAL021C 2514 nt7.2□□□□□ -1.26
SEF1P34228 UBP13YBL067C 2244 nt7.19□□□□□ -1.26
SEF1P34228 YBR056WYBR056W 1506 nt7.19□□□□□ -1.26
SEF1P34228 snR4snR4 186 nt7.18□□□□□ -1.26
SEF1P34228 YJL009WYJL009W 327 nt7.17□□□□□ -1.26
SEF1P34228 AAT1YKL106W 1356 nt7.17□□□□□ -1.26
SEF1P34228 ORT1YOR130C 879 nt7.16□□□□□ -1.26
SEF1P34228 COG1YGL223C 1254 nt7.15□□□□□ -1.26
SEF1P34228 TOP3YLR234W 1971 nt7.15□□□□□ -1.27
SEF1P34228 CHA1YCL064C 1083 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 STF1YDL130W-A 261 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 snR86snR86 1004 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YDR476CYDR476C 675 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YIL168WYIL168W 384 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YKR023WYKR023W 1593 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 PFS2YNL317W 1398 nt7.14□□□□□ -1.27
SEF1P34228 HSV2YGR223C 1347 nt7.13□□□□□ -1.27
SEF1P34228 RRT6YGL146C 936 nt7.13□□□□□ -1.27
SEF1P34228 RHO1YPR165W 630 nt7.13□□□□□ -1.27
SEF1P34228 HDA1YNL021W 2121 nt7.12□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YIL108WYIL108W 2091 nt7.12□□□□□ -1.27
SEF1P34228 PUP2YGR253C 783 nt7.12□□□□□ -1.27
SEF1P34228 HXT11YOL156W 1704 nt7.11□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YPT31YER031C 672 nt7.11□□□□□ -1.27
SEF1P34228 PUP3YER094C 618 nt7.11□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YLR358CYLR358C 564 nt7.11□□□□□ -1.27
SEF1P34228 ATP10YLR393W 840 nt7.11□□□□□ -1.27
SEF1P34228 TRP2YER090W 1524 nt7.11□□□□□ -1.27
SEF1P34228 ITR1YDR497C 1755 nt7.1□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YML079WYML079W 606 nt7.1□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YLR072WYLR072W 2082 nt7.09□□□□□ -1.27
SEF1P34228 FAF1YIL019W 1041 nt7.09□□□□□ -1.27
SEF1P34228 SHC1YER096W 1539 nt7.09□□□□□ -1.27
SEF1P34228 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.09□□□□□ -1.28
SEF1P34228 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.09□□□□□ -1.28
SEF1P34228 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.09□□□□□ -1.28
SEF1P34228 AFG2YLR397C 2343 nt7.09□□□□□ -1.28
SEF1P34228 MEP1YGR121C 1479 nt7.08□□□□□ -1.28
SEF1P34228 HAC1YFL031W 717 nt7.07□□□□□ -1.28
SEF1P34228 DOC1YGL240W 753 nt7.07□□□□□ -1.28
SEF1P34228 IDP3YNL009W 1263 nt7.07□□□□□ -1.28
SEF1P34228 SRM1YGL097W 1449 nt7.07□□□□□ -1.28
SEF1P34228 PSP2YML017W 1782 nt7.07□□□□□ -1.28
SEF1P34228 EHT1YBR177C 1356 nt7.07□□□□□ -1.28
SEF1P34228 URA1YKL216W 945 nt7.06□□□□□ -1.28
SEF1P34228 THI73YLR004C 1572 nt7.06□□□□□ -1.28
SEF1P34228 PRC1YMR297W 1599 nt7.05□□□□□ -1.28
SEF1P34228 ATG22YCL038C 1587 nt7.05□□□□□ -1.28
SEF1P34228 PMU1YKL128C 888 nt7.05□□□□□ -1.28
SEF1P34228 LRO1YNR008W 1986 nt7.05□□□□□ -1.28
SEF1P34228 YNL040WYNL040W 1371 nt7.05□□□□□ -1.28
SEF1P34228 TIM50YPL063W 1431 nt7.04□□□□□ -1.28
SEF1P34228 RCF1YML030W 480 nt7.04□□□□□ -1.28
SEF1P34228 YTH1YPR107C 627 nt7.04□□□□□ -1.28
SEF1P34228 SGV1YPR161C 1974 nt7.04□□□□□ -1.28
SEF1P34228 JHD1YER051W 1479 nt7.04□□□□□ -1.28
SEF1P34228 HXT13YEL069C 1695 nt7.03□□□□□ -1.28
SEF1P34228 BUD31YCR063W 474 nt7.03□□□□□ -1.28
SEF1P34228 ATO2YNR002C 849 nt7.03□□□□□ -1.28
SEF1P34228 MSB3YNL293W 1902 nt7.03□□□□□ -1.28
SEF1P34228 SLM3YDL033C 1254 nt7.02□□□□□ -1.29
SEF1P34228 GUT1YHL032C 2130 nt7.02□□□□□ -1.29
SEF1P34228 HIS3YOR202W 663 nt7.02□□□□□ -1.29
SEF1P34228 PRE10YOR362C 867 nt7.02□□□□□ -1.29
SEF1P34228 FTH1YBR207W 1398 nt7.02□□□□□ -1.29
SEF1P34228 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.01□□□□□ -1.29
SEF1P34228 HXT8YJL214W 1710 nt7.01□□□□□ -1.29
SEF1P34228 MAS2YHR024C 1449 nt7.01□□□□□ -1.29
SEF1P34228 LAT1YNL071W 1449 nt7.01□□□□□ -1.29
SEF1P34228 DIP5YPL265W 1827 nt7□□□□□ -1.29
SEF1P34228 PIH1YHR034C 1035 nt7□□□□□ -1.29
SEF1P34228 CPT1YNL130C 1182 nt7□□□□□ -1.29
SEF1P34228 KDX1YKL161C 1302 nt7□□□□□ -1.29
SEF1P34228 NDE2YDL085W 1638 nt6.99□□□□□ -1.29
SEF1P34228 YMR253CYMR253C 1245 nt6.99□□□□□ -1.29
SEF1P34228 LEA1YPL213W 717 nt6.99□□□□□ -1.29
SEF1P34228 ABP1YCR088W 1779 nt6.98□□□□□ -1.29
SEF1P34228 NCA3YJL116C 1014 nt6.98□□□□□ -1.29
SEF1P34228 YJL144WYJL144W 315 nt6.98□□□□□ -1.29
SEF1P34228 SPE4YLR146C 903 nt6.98□□□□□ -1.29
SEF1P34228 YOR300WYOR300W 309 nt6.98□□□□□ -1.29
SEF1P34228 WSC3YOL105C 1671 nt6.97□□□□□ -1.29
SEF1P34228 YAL019W-AYAL019W-A 570 nt6.97□□□□□ -1.29
SEF1P34228 TDA4YJR116W 840 nt6.97□□□□□ -1.29
SEF1P34228 MDH2YOL126C 1134 nt6.97□□□□□ -1.29
SEF1P34228 PNS1YOR161C 1620 nt6.97□□□□□ -1.29
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