Protein–RNA interactions for Protein: P30926

CHRNB4, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB4P30926 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CHRNB4P30926 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CHRNB4P30926 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CHRNB4P30926 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CHRNB4P30926 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms