Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
HOXD10P28358 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
HOXD10P28358 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
HOXD10P28358 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
HOXD10P28358 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HOXD10P28358 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 7.5 ms