Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NFKBIAP25963 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFKBIAP25963 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFKBIAP25963 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFKBIAP25963 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NFKBIAP25963 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms