Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.64■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC30.61■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
POLR2AP24928 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC30.57■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC30.54■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC30.53■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
POLR2AP24928 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC30.51■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
POLR2AP24928 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC30.4■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
POLR2AP24928 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
POLR2AP24928 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms