Protein–RNA interactions for Protein: P22314

UBA1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBA1P22314 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBA1P22314 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBA1P22314 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBA1P22314 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
UBA1P22314 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBA1P22314 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
UBA1P22314 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
UBA1P22314 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBA1P22314 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBA1P22314 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBA1P22314 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
UBA1P22314 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBA1P22314 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBA1P22314 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
UBA1P22314 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
UBA1P22314 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBA1P22314 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
UBA1P22314 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
UBA1P22314 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBA1P22314 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBA1P22314 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBA1P22314 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
UBA1P22314 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBA1P22314 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
UBA1P22314 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
UBA1P22314 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBA1P22314 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBA1P22314 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
UBA1P22314 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBA1P22314 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
UBA1P22314 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBA1P22314 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
UBA1P22314 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBA1P22314 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
UBA1P22314 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
UBA1P22314 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBA1P22314 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
UBA1P22314 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBA1P22314 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
UBA1P22314 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBA1P22314 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBA1P22314 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBA1P22314 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
UBA1P22314 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
UBA1P22314 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
UBA1P22314 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBA1P22314 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBA1P22314 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
UBA1P22314 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBA1P22314 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
UBA1P22314 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
UBA1P22314 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBA1P22314 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBA1P22314 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBA1P22314 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBA1P22314 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
UBA1P22314 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBA1P22314 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBA1P22314 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBA1P22314 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
UBA1P22314 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBA1P22314 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBA1P22314 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBA1P22314 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
UBA1P22314 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBA1P22314 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBA1P22314 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
UBA1P22314 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBA1P22314 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
UBA1P22314 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
UBA1P22314 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBA1P22314 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
UBA1P22314 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBA1P22314 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
UBA1P22314 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
UBA1P22314 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms