Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CXCL3P19876 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CXCL3P19876 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL3P19876 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CXCL3P19876 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL3P19876 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL3P19876 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL3P19876 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CXCL3P19876 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CXCL3P19876 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL3P19876 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL3P19876 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CXCL3P19876 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL3P19876 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL3P19876 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL3P19876 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CXCL3P19876 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL3P19876 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL3P19876 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL3P19876 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL3P19876 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CXCL3P19876 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
CXCL3P19876 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CXCL3P19876 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms