Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HOXB1P14653 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB1P14653 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
HOXB1P14653 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
HOXB1P14653 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.4 ms