Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYF5P13349 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MYF5P13349 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYF5P13349 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYF5P13349 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYF5P13349 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
MYF5P13349 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYF5P13349 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MYF5P13349 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYF5P13349 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYF5P13349 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYF5P13349 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYF5P13349 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
MYF5P13349 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYF5P13349 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYF5P13349 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYF5P13349 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MYF5P13349 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYF5P13349 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYF5P13349 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
MYF5P13349 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
MYF5P13349 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYF5P13349 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYF5P13349 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYF5P13349 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYF5P13349 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
MYF5P13349 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYF5P13349 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYF5P13349 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYF5P13349 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYF5P13349 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
MYF5P13349 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
MYF5P13349 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYF5P13349 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYF5P13349 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYF5P13349 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYF5P13349 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
MYF5P13349 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYF5P13349 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
MYF5P13349 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYF5P13349 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYF5P13349 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYF5P13349 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MYF5P13349 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYF5P13349 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
MYF5P13349 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYF5P13349 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYF5P13349 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MYF5P13349 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYF5P13349 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYF5P13349 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYF5P13349 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MYF5P13349 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYF5P13349 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYF5P13349 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYF5P13349 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYF5P13349 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYF5P13349 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MYF5P13349 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
MYF5P13349 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MYF5P13349 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYF5P13349 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MYF5P13349 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYF5P13349 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYF5P13349 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MYF5P13349 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
MYF5P13349 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYF5P13349 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYF5P13349 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MYF5P13349 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYF5P13349 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MYF5P13349 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
MYF5P13349 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYF5P13349 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYF5P13349 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MYF5P13349 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYF5P13349 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MYF5P13349 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYF5P13349 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYF5P13349 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MYF5P13349 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYF5P13349 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MYF5P13349 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYF5P13349 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYF5P13349 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MYF5P13349 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYF5P13349 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYF5P13349 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MYF5P13349 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MYF5P13349 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYF5P13349 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MYF5P13349 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms