Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
CYP2C9P11712 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CYP2C9P11712 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CYP2C9P11712 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CYP2C9P11712 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CYP2C9P11712 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms