Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CD8BP10966 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8BP10966 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8BP10966 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8BP10966 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CD8BP10966 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8BP10966 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CD8BP10966 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8BP10966 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8BP10966 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8BP10966 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8BP10966 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CD8BP10966 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CD8BP10966 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8BP10966 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8BP10966 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8BP10966 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CD8BP10966 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8BP10966 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8BP10966 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8BP10966 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8BP10966 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CD8BP10966 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD8BP10966 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CD8BP10966 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8BP10966 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8BP10966 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CD8BP10966 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CD8BP10966 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8BP10966 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8BP10966 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8BP10966 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CD8BP10966 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8BP10966 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CD8BP10966 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8BP10966 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8BP10966 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CD8BP10966 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8BP10966 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8BP10966 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8BP10966 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8BP10966 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CD8BP10966 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CD8BP10966 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8BP10966 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8BP10966 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8BP10966 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8BP10966 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8BP10966 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD8BP10966 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8BP10966 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8BP10966 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD8BP10966 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8BP10966 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8BP10966 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8BP10966 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8BP10966 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8BP10966 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CD8BP10966 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8BP10966 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8BP10966 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8BP10966 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8BP10966 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD8BP10966 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8BP10966 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8BP10966 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8BP10966 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8BP10966 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8BP10966 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD8BP10966 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD8BP10966 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms