Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
GLI3P10071 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
GLI3P10071 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI3P10071 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI3P10071 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
GLI3P10071 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI3P10071 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI3P10071 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
GLI3P10071 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
GLI3P10071 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
GLI3P10071 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
GLI3P10071 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI3P10071 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI3P10071 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI3P10071 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
GLI3P10071 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI3P10071 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
GLI3P10071 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI3P10071 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI3P10071 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI3P10071 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
GLI3P10071 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI3P10071 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI3P10071 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI3P10071 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
GLI3P10071 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI3P10071 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI3P10071 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
GLI3P10071 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI3P10071 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
GLI3P10071 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI3P10071 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI3P10071 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
GLI3P10071 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI3P10071 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI3P10071 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI3P10071 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
GLI3P10071 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI3P10071 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI3P10071 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI3P10071 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI3P10071 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
GLI3P10071 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI3P10071 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI3P10071 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI3P10071 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI3P10071 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
GLI3P10071 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI3P10071 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI3P10071 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI3P10071 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI3P10071 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
GLI3P10071 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
GLI3P10071 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
GLI3P10071 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI3P10071 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI3P10071 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI3P10071 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
GLI3P10071 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI3P10071 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI3P10071 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI3P10071 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
GLI3P10071 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI3P10071 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI3P10071 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI3P10071 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI3P10071 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
GLI3P10071 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI3P10071 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI3P10071 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
GLI3P10071 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
GLI3P10071 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI3P10071 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI3P10071 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI3P10071 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI3P10071 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
GLI3P10071 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
GLI3P10071 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI3P10071 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI3P10071 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI3P10071 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
GLI3P10071 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI3P10071 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI3P10071 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI3P10071 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI3P10071 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
GLI3P10071 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
GLI3P10071 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms