Protein–RNA interactions for Protein: P0DI82

TRAPPC2B, Trafficking protein particle complex subunit 2B, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC2BP0DI82 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TRAPPC2BP0DI82 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAPPC2BP0DI82 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
TRAPPC2BP0DI82 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TRAPPC2BP0DI82 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms