Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
FAM200BP0CF97 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM200BP0CF97 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
FAM200BP0CF97 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
FAM200BP0CF97 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FAM200BP0CF97 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms