Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
HOXC4P09017 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC4P09017 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC4P09017 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC4P09017 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
HOXC4P09017 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HOXC4P09017 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
HOXC4P09017 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
HOXC4P09017 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HOXC4P09017 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms