Protein–RNA interactions for Protein: P08962

CD63, CD63 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD63P08962 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD63P08962 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD63P08962 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD63P08962 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD63P08962 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CD63P08962 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD63P08962 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD63P08962 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD63P08962 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD63P08962 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CD63P08962 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD63P08962 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CD63P08962 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CD63P08962 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD63P08962 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CD63P08962 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD63P08962 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD63P08962 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD63P08962 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD63P08962 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CD63P08962 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD63P08962 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD63P08962 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD63P08962 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CD63P08962 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD63P08962 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD63P08962 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
CD63P08962 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CD63P08962 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD63P08962 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
CD63P08962 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
CD63P08962 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD63P08962 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
CD63P08962 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD63P08962 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD63P08962 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
CD63P08962 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
CD63P08962 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD63P08962 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD63P08962 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD63P08962 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD63P08962 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
CD63P08962 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD63P08962 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
CD63P08962 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD63P08962 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD63P08962 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
CD63P08962 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD63P08962 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD63P08962 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD63P08962 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
CD63P08962 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD63P08962 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD63P08962 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
CD63P08962 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD63P08962 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CD63P08962 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CD63P08962 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CD63P08962 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD63P08962 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CD63P08962 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CD63P08962 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD63P08962 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD63P08962 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD63P08962 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CD63P08962 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD63P08962 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD63P08962 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD63P08962 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD63P08962 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD63P08962 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CD63P08962 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD63P08962 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CD63P08962 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CD63P08962 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD63P08962 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD63P08962 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CD63P08962 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD63P08962 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CD63P08962 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD63P08962 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD63P08962 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD63P08962 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD63P08962 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CD63P08962 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CD63P08962 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD63P08962 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CD63P08962 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.4 ms