Protein–RNA interactions for Protein: P08572

COL4A2, Collagen alpha-2(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A2P08572 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
COL4A2P08572 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
COL4A2P08572 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
COL4A2P08572 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
COL4A2P08572 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
COL4A2P08572 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.1 ms