Protein–RNA interactions for Protein: P08397

HMBS, Porphobilinogen deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBSP08397 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
HMBSP08397 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
HMBSP08397 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMBSP08397 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMBSP08397 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
HMBSP08397 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMBSP08397 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMBSP08397 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMBSP08397 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
HMBSP08397 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMBSP08397 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
HMBSP08397 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMBSP08397 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
HMBSP08397 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMBSP08397 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMBSP08397 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMBSP08397 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMBSP08397 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
HMBSP08397 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
HMBSP08397 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMBSP08397 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMBSP08397 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMBSP08397 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
HMBSP08397 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMBSP08397 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
HMBSP08397 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMBSP08397 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMBSP08397 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
HMBSP08397 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMBSP08397 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
HMBSP08397 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
HMBSP08397 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMBSP08397 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMBSP08397 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMBSP08397 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
HMBSP08397 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
HMBSP08397 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMBSP08397 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMBSP08397 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMBSP08397 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMBSP08397 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
HMBSP08397 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMBSP08397 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMBSP08397 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
HMBSP08397 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
HMBSP08397 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMBSP08397 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMBSP08397 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMBSP08397 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMBSP08397 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
HMBSP08397 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMBSP08397 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMBSP08397 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
HMBSP08397 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMBSP08397 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMBSP08397 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMBSP08397 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMBSP08397 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
HMBSP08397 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
HMBSP08397 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms